Ekonomi sistem UV ditentukan oleh faktor-faktor berikut: biaya peralatan dan kehidupan; efisiensi listrik; tingkat pengurangan efek sterilisasi selama operasi; biaya listrik, dll. Analisis ekonomi dari sistem desinfeksi ultraviolet belum mencapai kesimpulan. Ada banyak laporan analisis dengan kesimpulan yang berbeda. Ada pendapat bahwa perangkat desinfeksi ultraviolet mengkonsumsi banyak listrik, dan pemeliharaan dan biaya peralatan tinggi. Untuk sistem besar, investasi peralatan lebih tinggi daripada sistem ozon, dan biaya operasi mirip dengan ozon; tetapi untuk sistem kecil produksi air murni, investasi lebih rendah daripada perangkat ozon. Ada juga pendapat bahwa untuk skala pengobatan ribuan ton / hari atau lebih, biaya investasi dan operasi sistem desinfeksi UV sangat menguntungkan, yang jauh lebih rendah daripada biaya klorinasi dan desinfeksi ozon. Misalnya, ada laporan data analitik bahwa ketika membangun pabrik pengolahan air minum kecil dengan populasi mulai dari 10 hingga 25.000, perkiraan rasio ultraviolet, klorin dioksida dan biaya desinfeksi ozon adalah 1:4: (8-9), untuk populasi yang lebih besar dari Untuk 500.000 organisasi sosial, rasio biaya adalah sekitar 1:2.5:2.5.
Perkiraan biaya ini tidak termasuk biaya tambahan untuk menghapus produk sampingan desinfeksi dan kista cryptosporidium saat menggunakan proses desinfeksi non-UV. Selain itu, data analisis menunjukkan bahwa biaya investasi dan pengoperasian desinfeksi ultraviolet lebih rendah daripada desinfeksi klorin, dan biaya desinfeksi sekitar setengah dari klorin, tetapi perbedaannya berkurang dengan perluasan skala pengolahan air.
Di Prancis dan bekas Uni Soviet, desinfeksi ultraviolet terbatas pada peralatan kecil. Peralatan besar yang didirikan adalah memasang lampu ultraviolet secara ber seri di sumber air yang disaring. Di Amerika Serikat, desinfeksi ultraviolet juga terbatas pada peralatan kecil dan kolam renang, dan sering dikombinasikan dengan disinfektan lainnya. Namun, telah dilaporkan dalam aplikasi praktis bahwa skala tanaman air minum menggunakan desinfeksi ultraviolet telah melebihi 1,5 juta ton per hari.